a. El rector adjunto, quien preside.
b. Los decanos.
c. El vicerrector de Vida Estudiantil.
d. La autoridad superior del Sistema de Estudios de Posgrado (Sepuna).
e. La autoridad superior de las secciones regionales y de las sedes interuniversitarias, las cuales participarán con voz pero sin voto.
f. La representación estudiantil correspondiente al veinticinco por ciento de la integración de este órgano colegiado, electa según lo establece el Estatuto de la Feuna.

Integración actual

Rectoría  adjunta:
Dra. Ana María Hernández Segura
     
Vicerrectoría de Vida Estudiantil:
Dra. Susana Ruíz Hidalgo
     
Centro de Estudios Generales:
Dr. Roberto Rojas Benavides, Decano - Dr. Miguel Baraona Cokerell, Vicedecano
     
Centro de Investigación y Docencia en Educación:
Dra. Ileana Castillo Cedeño, Decana - M.Ed. Sandra Ovares Barquero, Vicedecana
     
Centro de Investigación, Docencia y Extensión Artística:
Lic. Manuel Morales Pérez, Decano - M.Sc. Dora Cerdas Bokhan, Vicedecana
     
Facultad de Ciencias de la Salud:
Lic. Rafael Ángel Vindas Bolaños, Decano - Dr. Felipe Araya Ramírez, Vicedecano
     
Facultad de Ciencias Sociales:
Ph.D. Gerardo Jiménez Porras, Decano -   M.Sc. Marta Sanchéz López, Vicedecana
     
Facultad de Ciencias de la Tierra y el Mar:
M.Sc. Tomás Marino Herrera, Decano - Dr. Jorge Herrera Murillo, Vicedecano
     
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales:
M.Sc. Felipe Reyes Solares, Decano - Dr. Ronny Gamboa Araya, Vicedecano
     
Facultad de Filosofía y Letras:
Dr. Francisco MEna Oreamuno, Decano - M.Sc. Bibiana Núñez Álvarado, Vicedecana
     
Sede Regional Brunca:
MA. Jose Luis Díaz Naranjo, Decano - MA. Galili Jiménez Olivares, Vicedecana
     
Sede Regional Chorotega:
Dr. Víctor Julio Baltodano Zúñiga, Decano -   Dra. Doriam Chavarría López, Vicedecano
   
SEPUNA:
Ph.D. Mayela Coto Chotto, Presidente del CCP
     
Representación Estudiantil : 

Urpi Azucena Castañeda Wilca, FEUNA
Ruby Betancourt Losada, FEUNA
Carlos Andrés Venegas Elizondo, FEUNA
Daniel Bravo Morales, FEUNA